Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5861F6VCN9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms