Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erich3F6QRE9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erich3F6QRE9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms