Protein–RNA interactions for Protein: F6QI24

Gm7945, Predicted gene 7945 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7945F6QI24 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm7945F6QI24 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms