Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmod3E9QA62 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmod3E9QA62 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms