Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc7bE9Q9Y3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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