Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms