Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930451I11RikE9Q9R3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930451I11RikE9Q9R3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms