Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ankrd35E9Q9D8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd35E9Q9D8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms