Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp31E9Q6Y8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp31E9Q6Y8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp31E9Q6Y8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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