Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd1E9Q3H4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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