Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zfp558E9Q1J0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Zfp558E9Q1J0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Zfp558E9Q1J0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Zfp558E9Q1J0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp558E9Q1J0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp558E9Q1J0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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