Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt78E9Q0F0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms