Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm3095E9Q058 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms