Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fndc1E9Q043 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fndc1E9Q043 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms