Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms