Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd2E9PZM4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd2E9PZM4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms