Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph10bE9PYQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms