Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sfta2E9PXB6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms