Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3002E9PW72 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3002E9PW72 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms