Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FgaE9PV24 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms