Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd5D6MZJ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd5D6MZJ6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms