Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rdh8D3Z6W3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rdh8D3Z6W3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms