Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms