Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3543D3Z235 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3543D3Z235 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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