Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc13D3YV10 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms