Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm4950D3YUM8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm4950D3YUM8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms