Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr3aB2RXC6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr3aB2RXC6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr3aB2RXC6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms