Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cyp26c1B2RXA7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cyp26c1B2RXA7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms