Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cspp1B2RX88 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cspp1B2RX88 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms