Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cped1B2RX70 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms