Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cfap58B2RW38 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cfap58B2RW38 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms