Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrn3B2RS91 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms