Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cpb1B2RS76 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms