Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf518aB2RRF6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf518aB2RRF6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf518aB2RRF6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Znf518aB2RRF6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms