Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbed5B2RPU8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms