Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H60cB1B213 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms