Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CK137956B1AYM9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms