Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfrsf25B1AWN9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf25B1AWN9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms