Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trabd2bB1ATG9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms