Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spocd1B1ASB6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spocd1B1ASB6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms