Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Prr29B1ARI9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms