Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Skint4A7TZF3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Skint4A7TZF3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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