Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttll6A4Q9E8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttll6A4Q9E8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms