Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf2A3KGV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms