Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp8b5A3FIN4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp8b5A3FIN4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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