Protein–RNA interactions for Protein: A2BIE1

Qser1, Glutamine and serine-rich 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Qser1A2BIE1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Qser1A2BIE1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Qser1A2BIE1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Qser1A2BIE1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms