Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Samt1A2BED8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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