Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rtf1A2AQ19 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rtf1A2AQ19 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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