Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb1A2AQ07 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms