Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scn1aA2APX8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms